源于子姓，出自商朝大臣南门蠕之后裔，属于以先祖名号或官职称谓为氏。传说，在上古商王朝初期，君主成汤属下有位重臣叫南门蠕，在典籍《鬻子》中，就提到南门氏的始祖是南门蠕。当年商汤王朝建立之初，汤王属下有七位名臣，分别是：庆辅、伊尹、湟里且、东门虚、南门蠕、西门疵、北门侧，其中的南门蠕就是这七位重要佐臣之一。